Visi PS Doktor IK adalah: “Menjadi Program Studi yang Unggul dan Lulusan yang Berdaya Saing Dalam Pengembangan Ilmu Pengetahuan, Teknologi, dan Seni (IPTEKS) Berbasis Sumberdaya Kelautan dan Perikanan Kepulauan Tahun 2025”

Dalam pencapaian Visi penyelenggaraan Pendidikan Doktoral pada pascasarjana UNPATTI Visi PS Doktor IK mengandung arti sebagai berikut:

• “PS yang Unggul” berarti PS yang handal, memiliki manajemen yang kredibel, akuntabel, transparan, bertanggung jawab dan adil.
• ‘’Lulusan yang berdaya saing’’ berarti lulusan doktor Ilmu Kelautan memiliki keunggulan kompetitif Ilmu Pengetahuan, Teknologi, dan Seni (IPTEKS) di bidang kelautan dan perikanan kepulauan;
• “Pengembangan Ilmu Pengetahuan, Teknologi, dan Seni (IPTEKS)’’ berarti lulusan Doktor yang dihasilkan harus mampu mengembangkan IPTEKS kelautan dan perikanan kepulauan secara komprehensif bagi pembangunan daerah secara khusus serta bangsa dan negara secara umum.
• “Berbasis Sumberdaya Kelautan dan Perikanan Kepulauan” berarti   lulusan Doktor yang dihasilkan harus mampu mengembangkan sumberdaya kelautan dan perikanan kepulauan bagi pembangunan daerah secara khusus serta bangsa dan negara secara umum.

Tahun 2025 adalah merupakan tahun pencapaian Visi program doktor yang akan diupayakan untuk diwujudkan oleh seluruh civitas PS.

Misi Program Studi PS Doktor IK adalah:

1. Menyelenggarakan pendidikan doktor yang berkualitas dan unggul dalam penguasaan dan pengembangan IPTEKS di bidang kelautan dan perikanan kepulauan, baik secara teori, konsep maupun metodologi.
2. Menyelenggarakan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat, yang mendukung pengembangan dan penerapan IPTEKS dalam menyelesaikan permasalahan di bidang kelautan dan perikanan kepulauan untuk pembangunan  berkelanjutan.
4. Meningkatkan kapasitas dan daya saing pendidikan Doktor Ilmu Kelautan, melalui pengembangan dan penerapan IPTEKS dalam bidang kelautan dan perikanan kepulauan.